NVIDIA представила BioNeMo Inference Runtime (BioIR), новую библиотеку Python, предназначенную для ускорения предсказания структуры белков на графических процессорах. BioIR обеспечивает 2.90x увеличение производительности по сравнению с предыдущими моделями и позволяет обрабатывать до 58,5 тыс. остатков на GPU-час при использовании 8 графических процессоров H100.
С переходом к работе на уровне протеомов, скорость обработки очередей независимых целей стала критически важной. BioIR уже продемонстрировала свою эффективность на производственных масштабах, поддерживая недавнее расширение базы данных AlphaFold, в результате чего было сгенерировано 31 миллион кандидатов на комплексы белков, из которых 1.81 миллиона были выпущены как высоконадежные предсказания.
BioIR доступен в виде открытого репозитория на GitHub и требует Python 3.12+, совместимый графический процессор NVIDIA и драйвер. Это решение открывает новые возможности для исследователей в области биомолекулярной структуры, ускоряя процесс предсказания и анализа белков.